Kompetensi keahlian saat itu adalah Teknik Audio Video (TAV) dan Teknik Kendaraan Ringan (TKR) yang masing-masing mempunyai 1 rombel atau kelas. Sesuai kebutuhan masyarakat akhirnya pada tahun 2006 SMK Negeri 2 Kudus Menjadi SMK Besar. Dengan jumlah rombel masing-masing kompetensi keahlian 2 rombel. Pada tahun 2008 bertambah menjadi 3 rombel dan tahun 2009 menjadi 4 rombel untuk masing-masing Kompetensi Keahlian.
Kepemimpinan SMK Negeri 2 Kudus pada tahun 2006 oleh Drs. Sudirman, M.Pd berakhir tahun 2010.Sejarah kepemimpinan akhirnya dilanjutkan oleh Bapak Drs. Harto Sundoyo dan saat ini kepemimpinan di pegang oleh Bapak Budi Susanto, S.Pd., M.Pd. ,SMK Negeri 2 Kudus berkembang dengan pesat dengan dibangunnya infrastruktur dan peningkatan peralatan praktik.
Pada tahun 2011 Program Keahlian di SMK Negeri 2 Kudus bertambah satu Program Keahlian yaitu Program Keahlian Teknik Komputer dan Jaringan ( TKJ ), walaupun merupakan Kompetensi Keahliann Baru, TKJ pada SMK Negeri 2 Kudus sudah memiliki peralatan praktik yang baik dan lengkap.
Pada tahun pelajaran 2011/2012 jumlah kelas mencapai 25 kelas. yaitu 4 kelas pararel dari kelas X, XI dan XII untuk Kompetensi Keahlian Teknik Audio Video dan Teknik Kendaraan Ringan serta 1 kelas (rombel) untuk Kompetensi Keahlian Teknik Komputer dan Jaringan.
Dari tahun ketahun animo masyarakat terhadap SMK Negeri 2 Kudus semakin besar, terbukti dengan semakin meningkatnya pendaftar peserta didik baru. Yang mana kurang lebih 70 % pendaftar tidak tertampung di SMK Negeri 2 Kudus.